Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGA3Q16281 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA3Q16281 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA3Q16281 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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