Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCM1Q15154 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCM1Q15154 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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