Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE4AQ14139 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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UBE4AQ14139 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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UBE4AQ14139 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE4AQ14139 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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UBE4AQ14139 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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UBE4AQ14139 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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UBE4AQ14139 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
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UBE4AQ14139 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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UBE4AQ14139 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE4AQ14139 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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UBE4AQ14139 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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UBE4AQ14139 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE4AQ14139 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE4AQ14139 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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UBE4AQ14139 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE4AQ14139 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE4AQ14139 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE4AQ14139 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBE4AQ14139 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBE4AQ14139 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UBE4AQ14139 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE4AQ14139 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE4AQ14139 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
UBE4AQ14139 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE4AQ14139 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE4AQ14139 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE4AQ14139 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBE4AQ14139 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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