Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CNGB1Q14028 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CNGB1Q14028 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGB1Q14028 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
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