Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX1Q13596 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX1Q13596 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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