Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AP3B2Q13367 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3B2Q13367 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3B2Q13367 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
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