Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC16Q13042 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms