Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRN3Q13033 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRN3Q13033 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN3Q13033 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN3Q13033 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
STRN3Q13033 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN3Q13033 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN3Q13033 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN3Q13033 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN3Q13033 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRN3Q13033 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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