Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXM1Q08050 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXM1Q08050 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms