Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RING1Q06587 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RING1Q06587 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RING1Q06587 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RING1Q06587 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RING1Q06587 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RING1Q06587 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RING1Q06587 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RING1Q06587 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RING1Q06587 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RING1Q06587 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RING1Q06587 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RING1Q06587 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RING1Q06587 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RING1Q06587 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RING1Q06587 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RING1Q06587 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RING1Q06587 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RING1Q06587 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RING1Q06587 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RING1Q06587 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RING1Q06587 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RING1Q06587 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RING1Q06587 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RING1Q06587 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RING1Q06587 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RING1Q06587 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RING1Q06587 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RING1Q06587 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RING1Q06587 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RING1Q06587 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RING1Q06587 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RING1Q06587 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RING1Q06587 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RING1Q06587 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RING1Q06587 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RING1Q06587 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RING1Q06587 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RING1Q06587 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RING1Q06587 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RING1Q06587 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RING1Q06587 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RING1Q06587 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RING1Q06587 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RING1Q06587 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RING1Q06587 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RING1Q06587 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RING1Q06587 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RING1Q06587 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RING1Q06587 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RING1Q06587 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RING1Q06587 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RING1Q06587 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RING1Q06587 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RING1Q06587 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RING1Q06587 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RING1Q06587 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RING1Q06587 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RING1Q06587 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RING1Q06587 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RING1Q06587 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RING1Q06587 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RING1Q06587 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RING1Q06587 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RING1Q06587 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RING1Q06587 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RING1Q06587 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RING1Q06587 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RING1Q06587 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RING1Q06587 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RING1Q06587 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RING1Q06587 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RING1Q06587 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RING1Q06587 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RING1Q06587 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms