Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EMX2Q04743 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMX2Q04743 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms