Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN1Q04323 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBXN1Q04323 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN1Q04323 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms