Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DEFA5Q01523 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DEFA5Q01523 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DEFA5Q01523 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEFA5Q01523 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DEFA5Q01523 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms