Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED6P86452 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED6P86452 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED6P86452 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED6P86452 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED6P86452 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED6P86452 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED6P86452 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED6P86452 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZBED6P86452 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED6P86452 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms