Protein–RNA interactions for Protein: P63010

AP2B1, AP-2 complex subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2B1P63010 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AP2B1P63010 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP2B1P63010 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP2B1P63010 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms