Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2LP62875 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2LP62875 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms