Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL23AP62750 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms