Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFM1P61960 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFM1P61960 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFM1P61960 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UFM1P61960 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFM1P61960 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFM1P61960 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFM1P61960 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFM1P61960 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFM1P61960 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFM1P61960 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UFM1P61960 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UFM1P61960 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UFM1P61960 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFM1P61960 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFM1P61960 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFM1P61960 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFM1P61960 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFM1P61960 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFM1P61960 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFM1P61960 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFM1P61960 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFM1P61960 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UFM1P61960 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UFM1P61960 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFM1P61960 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFM1P61960 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFM1P61960 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFM1P61960 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFM1P61960 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UFM1P61960 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFM1P61960 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFM1P61960 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFM1P61960 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFM1P61960 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFM1P61960 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFM1P61960 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFM1P61960 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UFM1P61960 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFM1P61960 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UFM1P61960 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFM1P61960 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFM1P61960 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFM1P61960 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFM1P61960 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFM1P61960 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFM1P61960 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFM1P61960 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UFM1P61960 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UFM1P61960 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFM1P61960 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFM1P61960 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFM1P61960 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFM1P61960 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFM1P61960 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFM1P61960 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UFM1P61960 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFM1P61960 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFM1P61960 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFM1P61960 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UFM1P61960 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFM1P61960 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFM1P61960 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UFM1P61960 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UFM1P61960 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UFM1P61960 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UFM1P61960 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UFM1P61960 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UFM1P61960 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UFM1P61960 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UFM1P61960 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UFM1P61960 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UFM1P61960 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFM1P61960 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFM1P61960 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFM1P61960 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFM1P61960 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UFM1P61960 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UFM1P61960 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFM1P61960 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFM1P61960 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFM1P61960 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UFM1P61960 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms