Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTR1AP61163 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR1AP61163 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTR1AP61163 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR1AP61163 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR1AP61163 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR1AP61163 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR1AP61163 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR1AP61163 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR1AP61163 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR1AP61163 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms