Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVFRD-1P60508 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms