Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX9P55771 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX9P55771 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX9P55771 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAX9P55771 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAX9P55771 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PAX9P55771 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PAX9P55771 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX9P55771 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX9P55771 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX9P55771 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX9P55771 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX9P55771 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX9P55771 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAX9P55771 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAX9P55771 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAX9P55771 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAX9P55771 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAX9P55771 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAX9P55771 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms