Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYS2P54840 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYS2P54840 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYS2P54840 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GYS2P54840 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GYS2P54840 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYS2P54840 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYS2P54840 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYS2P54840 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYS2P54840 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYS2P54840 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYS2P54840 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYS2P54840 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYS2P54840 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYS2P54840 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYS2P54840 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYS2P54840 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYS2P54840 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GYS2P54840 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYS2P54840 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYS2P54840 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GYS2P54840 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GYS2P54840 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GYS2P54840 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GYS2P54840 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GYS2P54840 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GYS2P54840 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GYS2P54840 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GYS2P54840 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GYS2P54840 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GYS2P54840 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GYS2P54840 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GYS2P54840 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GYS2P54840 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GYS2P54840 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GYS2P54840 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GYS2P54840 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GYS2P54840 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GYS2P54840 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GYS2P54840 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GYS2P54840 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GYS2P54840 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GYS2P54840 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GYS2P54840 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GYS2P54840 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GYS2P54840 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GYS2P54840 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GYS2P54840 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GYS2P54840 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GYS2P54840 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GYS2P54840 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GYS2P54840 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GYS2P54840 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GYS2P54840 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GYS2P54840 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GYS2P54840 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GYS2P54840 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GYS2P54840 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GYS2P54840 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYS2P54840 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYS2P54840 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYS2P54840 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYS2P54840 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYS2P54840 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYS2P54840 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYS2P54840 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYS2P54840 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYS2P54840 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYS2P54840 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYS2P54840 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYS2P54840 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GYS2P54840 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GYS2P54840 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GYS2P54840 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms