Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX2P52951 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX2P52951 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX2P52951 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX2P52951 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX2P52951 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX2P52951 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX2P52951 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX2P52951 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX2P52951 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX2P52951 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX2P52951 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX2P52951 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX2P52951 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX2P52951 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX2P52951 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBX2P52951 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX2P52951 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX2P52951 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX2P52951 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX2P52951 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX2P52951 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX2P52951 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX2P52951 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX2P52951 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX2P52951 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX2P52951 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX2P52951 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBX2P52951 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX2P52951 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX2P52951 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX2P52951 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX2P52951 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX2P52951 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX2P52951 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX2P52951 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX2P52951 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX2P52951 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX2P52951 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBX2P52951 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GBX2P52951 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GBX2P52951 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GBX2P52951 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GBX2P52951 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBX2P52951 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBX2P52951 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBX2P52951 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBX2P52951 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBX2P52951 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBX2P52951 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBX2P52951 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBX2P52951 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBX2P52951 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBX2P52951 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBX2P52951 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBX2P52951 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBX2P52951 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBX2P52951 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GBX2P52951 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBX2P52951 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBX2P52951 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GBX2P52951 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBX2P52951 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GBX2P52951 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBX2P52951 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBX2P52951 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBX2P52951 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBX2P52951 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBX2P52951 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBX2P52951 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBX2P52951 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBX2P52951 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBX2P52951 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBX2P52951 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBX2P52951 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GBX2P52951 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX2P52951 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms