Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2JP52435 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2JP52435 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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