Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAP1GDS1P52306 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAP1GDS1P52306 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAP1GDS1P52306 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAP1GDS1P52306 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAP1GDS1P52306 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAP1GDS1P52306 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAP1GDS1P52306 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAP1GDS1P52306 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAP1GDS1P52306 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAP1GDS1P52306 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAP1GDS1P52306 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1GDS1P52306 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms