Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SMARCA4P51532 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC41.69■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
SMARCA4P51532 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
SMARCA4P51532 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC41.63■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms