Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCT8P50990 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8P50990 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8P50990 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8P50990 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8P50990 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8P50990 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8P50990 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8P50990 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8P50990 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8P50990 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8P50990 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCT8P50990 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCT8P50990 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT8P50990 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT8P50990 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT8P50990 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT8P50990 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT8P50990 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCT8P50990 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8P50990 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8P50990 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8P50990 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8P50990 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8P50990 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8P50990 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8P50990 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8P50990 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCT8P50990 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8P50990 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8P50990 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8P50990 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8P50990 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8P50990 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8P50990 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8P50990 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8P50990 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8P50990 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8P50990 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCT8P50990 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8P50990 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8P50990 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8P50990 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8P50990 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8P50990 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8P50990 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8P50990 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8P50990 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCT8P50990 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8P50990 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8P50990 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8P50990 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8P50990 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8P50990 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8P50990 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCT8P50990 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8P50990 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8P50990 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8P50990 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8P50990 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8P50990 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8P50990 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8P50990 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8P50990 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8P50990 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8P50990 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT8P50990 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT8P50990 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT8P50990 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT8P50990 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT8P50990 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT8P50990 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCT8P50990 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCT8P50990 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT8P50990 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms