Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX2P50458 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX2P50458 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX2P50458 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX2P50458 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX2P50458 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX2P50458 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX2P50458 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX2P50458 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX2P50458 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX2P50458 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX2P50458 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX2P50458 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX2P50458 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX2P50458 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX2P50458 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX2P50458 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX2P50458 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX2P50458 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX2P50458 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX2P50458 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX2P50458 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX2P50458 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX2P50458 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX2P50458 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX2P50458 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX2P50458 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX2P50458 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX2P50458 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX2P50458 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX2P50458 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX2P50458 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX2P50458 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX2P50458 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX2P50458 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX2P50458 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX2P50458 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX2P50458 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX2P50458 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX2P50458 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX2P50458 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX2P50458 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX2P50458 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX2P50458 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX2P50458 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX2P50458 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX2P50458 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX2P50458 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX2P50458 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX2P50458 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX2P50458 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX2P50458 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX2P50458 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX2P50458 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX2P50458 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX2P50458 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX2P50458 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX2P50458 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX2P50458 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX2P50458 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX2P50458 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX2P50458 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX2P50458 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX2P50458 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX2P50458 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX2P50458 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX2P50458 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX2P50458 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX2P50458 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX2P50458 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX2P50458 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX2P50458 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX2P50458 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX2P50458 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX2P50458 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX2P50458 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX2P50458 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX2P50458 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX2P50458 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX2P50458 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX2P50458 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX2P50458 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX2P50458 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX2P50458 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX2P50458 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX2P50458 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX2P50458 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHX2P50458 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms