Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB2P49721 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms