Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC34P49427 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC34P49427 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC34P49427 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC34P49427 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC34P49427 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC34P49427 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC34P49427 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC34P49427 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC34P49427 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC34P49427 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC34P49427 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC34P49427 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC34P49427 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC34P49427 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC34P49427 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC34P49427 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC34P49427 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC34P49427 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC34P49427 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC34P49427 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC34P49427 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC34P49427 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC34P49427 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC34P49427 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC34P49427 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC34P49427 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC34P49427 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC34P49427 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC34P49427 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC34P49427 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC34P49427 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC34P49427 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC34P49427 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC34P49427 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC34P49427 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC34P49427 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC34P49427 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC34P49427 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC34P49427 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC34P49427 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC34P49427 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC34P49427 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC34P49427 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC34P49427 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC34P49427 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC34P49427 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDC34P49427 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC34P49427 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms