Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK8P49336 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK8P49336 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CDK8P49336 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CDK8P49336 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK8P49336 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK8P49336 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK8P49336 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK8P49336 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK8P49336 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK8P49336 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK8P49336 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK8P49336 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK8P49336 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK8P49336 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK8P49336 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK8P49336 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK8P49336 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK8P49336 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK8P49336 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK8P49336 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK8P49336 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK8P49336 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK8P49336 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK8P49336 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK8P49336 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK8P49336 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK8P49336 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK8P49336 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK8P49336 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK8P49336 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK8P49336 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK8P49336 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK8P49336 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK8P49336 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK8P49336 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK8P49336 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK8P49336 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK8P49336 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK8P49336 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK8P49336 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK8P49336 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDK8P49336 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK8P49336 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK8P49336 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK8P49336 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK8P49336 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK8P49336 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK8P49336 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK8P49336 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK8P49336 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK8P49336 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK8P49336 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK8P49336 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK8P49336 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK8P49336 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK8P49336 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK8P49336 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK8P49336 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK8P49336 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK8P49336 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK8P49336 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK8P49336 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK8P49336 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK8P49336 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK8P49336 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK8P49336 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK8P49336 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK8P49336 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK8P49336 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK8P49336 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK8P49336 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK8P49336 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK8P49336 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK8P49336 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK8P49336 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK8P49336 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK8P49336 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK8P49336 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK8P49336 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK8P49336 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK8P49336 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK8P49336 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK8P49336 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK8P49336 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK8P49336 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK8P49336 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK8P49336 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK8P49336 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK8P49336 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK8P49336 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK8P49336 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK8P49336 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK8P49336 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK8P49336 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK8P49336 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK8P49336 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK8P49336 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK8P49336 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK8P49336 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms