Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POU3F4P49335 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POU3F4P49335 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms