Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX1P48742 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX1P48742 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX1P48742 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX1P48742 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX1P48742 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX1P48742 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX1P48742 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX1P48742 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX1P48742 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX1P48742 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX1P48742 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX1P48742 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX1P48742 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX1P48742 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX1P48742 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX1P48742 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX1P48742 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX1P48742 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX1P48742 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX1P48742 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX1P48742 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX1P48742 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX1P48742 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX1P48742 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX1P48742 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX1P48742 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LHX1P48742 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LHX1P48742 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LHX1P48742 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LHX1P48742 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX1P48742 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX1P48742 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX1P48742 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX1P48742 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX1P48742 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX1P48742 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX1P48742 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX1P48742 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX1P48742 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX1P48742 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX1P48742 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX1P48742 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX1P48742 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX1P48742 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX1P48742 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX1P48742 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX1P48742 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX1P48742 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX1P48742 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX1P48742 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX1P48742 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX1P48742 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX1P48742 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX1P48742 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX1P48742 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX1P48742 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX1P48742 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX1P48742 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX1P48742 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX1P48742 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX1P48742 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX1P48742 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX1P48742 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX1P48742 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX1P48742 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX1P48742 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX1P48742 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX1P48742 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX1P48742 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX1P48742 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX1P48742 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX1P48742 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX1P48742 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX1P48742 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms