Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNC1P48547 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC1P48547 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms