Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFX2P48378 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFX2P48378 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFX2P48378 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFX2P48378 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFX2P48378 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFX2P48378 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFX2P48378 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RFX2P48378 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFX2P48378 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFX2P48378 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFX2P48378 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFX2P48378 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFX2P48378 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFX2P48378 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFX2P48378 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFX2P48378 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFX2P48378 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFX2P48378 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFX2P48378 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFX2P48378 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFX2P48378 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFX2P48378 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFX2P48378 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFX2P48378 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFX2P48378 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFX2P48378 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFX2P48378 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFX2P48378 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFX2P48378 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFX2P48378 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFX2P48378 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RFX2P48378 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFX2P48378 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFX2P48378 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFX2P48378 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFX2P48378 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFX2P48378 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFX2P48378 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFX2P48378 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFX2P48378 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFX2P48378 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RFX2P48378 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFX2P48378 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFX2P48378 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFX2P48378 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFX2P48378 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFX2P48378 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFX2P48378 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFX2P48378 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFX2P48378 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFX2P48378 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFX2P48378 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFX2P48378 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFX2P48378 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFX2P48378 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFX2P48378 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFX2P48378 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFX2P48378 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFX2P48378 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFX2P48378 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFX2P48378 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFX2P48378 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFX2P48378 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFX2P48378 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFX2P48378 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFX2P48378 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFX2P48378 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFX2P48378 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFX2P48378 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFX2P48378 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFX2P48378 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFX2P48378 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFX2P48378 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFX2P48378 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFX2P48378 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFX2P48378 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFX2P48378 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFX2P48378 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFX2P48378 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFX2P48378 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFX2P48378 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFX2P48378 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RFX2P48378 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFX2P48378 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFX2P48378 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms