Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CXCL5P42830 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL5P42830 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms