Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP8P40818 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP8P40818 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP8P40818 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP8P40818 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP8P40818 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP8P40818 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP8P40818 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP8P40818 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP8P40818 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP8P40818 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP8P40818 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP8P40818 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP8P40818 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP8P40818 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP8P40818 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP8P40818 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP8P40818 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP8P40818 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP8P40818 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP8P40818 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP8P40818 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP8P40818 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP8P40818 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP8P40818 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP8P40818 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP8P40818 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP8P40818 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP8P40818 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP8P40818 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP8P40818 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP8P40818 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP8P40818 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP8P40818 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP8P40818 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP8P40818 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP8P40818 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP8P40818 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP8P40818 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP8P40818 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP8P40818 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP8P40818 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP8P40818 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP8P40818 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP8P40818 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP8P40818 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP8P40818 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP8P40818 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP8P40818 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP8P40818 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP8P40818 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP8P40818 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP8P40818 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP8P40818 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP8P40818 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP8P40818 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP8P40818 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP8P40818 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP8P40818 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP8P40818 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP8P40818 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP8P40818 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP8P40818 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP8P40818 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP8P40818 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP8P40818 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP8P40818 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP8P40818 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP8P40818 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP8P40818 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP8P40818 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP8P40818 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP8P40818 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP8P40818 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP8P40818 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP8P40818 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP8P40818 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP8P40818 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP8P40818 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP8P40818 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP8P40818 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP8P40818 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP8P40818 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP8P40818 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms