Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA9P38646 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA9P38646 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms