Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLC1P35663 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLC1P35663 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms