Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC1P35052 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC1P35052 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC1P35052 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC1P35052 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC1P35052 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC1P35052 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC1P35052 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC1P35052 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC1P35052 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC1P35052 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC1P35052 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC1P35052 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC1P35052 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC1P35052 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC1P35052 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC1P35052 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC1P35052 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC1P35052 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC1P35052 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC1P35052 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC1P35052 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC1P35052 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC1P35052 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC1P35052 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC1P35052 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC1P35052 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC1P35052 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC1P35052 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC1P35052 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC1P35052 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC1P35052 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC1P35052 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC1P35052 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC1P35052 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC1P35052 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC1P35052 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC1P35052 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC1P35052 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC1P35052 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC1P35052 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC1P35052 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC1P35052 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC1P35052 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC1P35052 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC1P35052 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC1P35052 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC1P35052 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC1P35052 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC1P35052 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC1P35052 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC1P35052 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC1P35052 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC1P35052 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC1P35052 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC1P35052 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC1P35052 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC1P35052 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC1P35052 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms