Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP1P32455 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP1P32455 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP1P32455 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP1P32455 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP1P32455 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP1P32455 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP1P32455 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP1P32455 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP1P32455 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP1P32455 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP1P32455 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP1P32455 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP1P32455 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP1P32455 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP1P32455 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP1P32455 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP1P32455 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP1P32455 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP1P32455 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP1P32455 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP1P32455 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP1P32455 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP1P32455 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP1P32455 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP1P32455 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP1P32455 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP1P32455 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GBP1P32455 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GBP1P32455 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP1P32455 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP1P32455 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP1P32455 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP1P32455 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP1P32455 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP1P32455 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP1P32455 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP1P32455 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP1P32455 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP1P32455 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP1P32455 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP1P32455 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP1P32455 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP1P32455 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP1P32455 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP1P32455 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP1P32455 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP1P32455 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP1P32455 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP1P32455 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP1P32455 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP1P32455 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP1P32455 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP1P32455 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP1P32455 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP1P32455 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP1P32455 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP1P32455 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP1P32455 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP1P32455 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP1P32455 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP1P32455 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP1P32455 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP1P32455 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP1P32455 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP1P32455 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP1P32455 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP1P32455 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP1P32455 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP1P32455 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP1P32455 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP1P32455 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP1P32455 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP1P32455 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP1P32455 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP1P32455 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP1P32455 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP1P32455 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP1P32455 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP1P32455 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP1P32455 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP1P32455 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP1P32455 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP1P32455 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP1P32455 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP1P32455 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP1P32455 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP1P32455 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP1P32455 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP1P32455 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP1P32455 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP1P32455 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP1P32455 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP1P32455 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP1P32455 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP1P32455 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP1P32455 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP1P32455 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP1P32455 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP1P32455 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms