Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPOP30536 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPOP30536 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPOP30536 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPOP30536 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPOP30536 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPOP30536 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPOP30536 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSPOP30536 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSPOP30536 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSPOP30536 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSPOP30536 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSPOP30536 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSPOP30536 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSPOP30536 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TSPOP30536 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSPOP30536 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TSPOP30536 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSPOP30536 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSPOP30536 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSPOP30536 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPOP30536 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPOP30536 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPOP30536 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPOP30536 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSPOP30536 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSPOP30536 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSPOP30536 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSPOP30536 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSPOP30536 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms