Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCSK1P29120 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK1P29120 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK1P29120 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms