Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF8P28908 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms