Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD1P28289 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.8 ms