Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPH2P23942 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms