Protein–RNA interactions for Protein: P23560

BDNF, Brain-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNFP23560 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BDNFP23560 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BDNFP23560 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BDNFP23560 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BDNFP23560 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BDNFP23560 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BDNFP23560 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BDNFP23560 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BDNFP23560 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BDNFP23560 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BDNFP23560 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BDNFP23560 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BDNFP23560 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BDNFP23560 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BDNFP23560 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BDNFP23560 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BDNFP23560 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BDNFP23560 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BDNFP23560 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BDNFP23560 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BDNFP23560 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BDNFP23560 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BDNFP23560 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BDNFP23560 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BDNFP23560 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BDNFP23560 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BDNFP23560 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BDNFP23560 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BDNFP23560 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BDNFP23560 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BDNFP23560 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BDNFP23560 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BDNFP23560 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BDNFP23560 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BDNFP23560 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BDNFP23560 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BDNFP23560 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BDNFP23560 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BDNFP23560 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BDNFP23560 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BDNFP23560 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BDNFP23560 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BDNFP23560 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BDNFP23560 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BDNFP23560 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BDNFP23560 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BDNFP23560 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BDNFP23560 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BDNFP23560 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BDNFP23560 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BDNFP23560 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BDNFP23560 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BDNFP23560 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BDNFP23560 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BDNFP23560 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BDNFP23560 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BDNFP23560 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BDNFP23560 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BDNFP23560 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BDNFP23560 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BDNFP23560 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BDNFP23560 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BDNFP23560 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BDNFP23560 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BDNFP23560 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BDNFP23560 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BDNFP23560 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BDNFP23560 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BDNFP23560 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BDNFP23560 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BDNFP23560 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BDNFP23560 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BDNFP23560 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BDNFP23560 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BDNFP23560 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BDNFP23560 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BDNFP23560 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BDNFP23560 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BDNFP23560 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BDNFP23560 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BDNFP23560 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BDNFP23560 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BDNFP23560 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BDNFP23560 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BDNFP23560 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BDNFP23560 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BDNFP23560 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BDNFP23560 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BDNFP23560 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BDNFP23560 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BDNFP23560 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BDNFP23560 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BDNFP23560 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BDNFP23560 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BDNFP23560 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BDNFP23560 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BDNFP23560 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BDNFP23560 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BDNFP23560 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BDNFP23560 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms