Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HRCP23327 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HRCP23327 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HRCP23327 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HRCP23327 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
HRCP23327 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HRCP23327 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HRCP23327 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
HRCP23327 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
HRCP23327 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
HRCP23327 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HRCP23327 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HRCP23327 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
HRCP23327 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HRCP23327 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
HRCP23327 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
HRCP23327 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
HRCP23327 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
HRCP23327 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
HRCP23327 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
HRCP23327 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
HRCP23327 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HRCP23327 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HRCP23327 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HRCP23327 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HRCP23327 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HRCP23327 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
HRCP23327 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HRCP23327 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HRCP23327 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
HRCP23327 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
HRCP23327 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
HRCP23327 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
HRCP23327 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
HRCP23327 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HRCP23327 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HRCP23327 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
HRCP23327 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
HRCP23327 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HRCP23327 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HRCP23327 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
HRCP23327 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HRCP23327 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HRCP23327 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HRCP23327 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HRCP23327 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HRCP23327 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HRCP23327 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HRCP23327 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HRCP23327 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HRCP23327 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HRCP23327 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HRCP23327 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
HRCP23327 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
HRCP23327 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
HRCP23327 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
HRCP23327 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
HRCP23327 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
HRCP23327 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
HRCP23327 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
HRCP23327 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
HRCP23327 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
HRCP23327 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
HRCP23327 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
HRCP23327 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
HRCP23327 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
HRCP23327 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
HRCP23327 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HRCP23327 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
HRCP23327 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HRCP23327 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HRCP23327 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
HRCP23327 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
HRCP23327 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HRCP23327 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HRCP23327 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HRCP23327 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HRCP23327 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HRCP23327 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HRCP23327 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
HRCP23327 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
HRCP23327 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
HRCP23327 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
HRCP23327 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
HRCP23327 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
HRCP23327 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
HRCP23327 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
HRCP23327 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
HRCP23327 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HRCP23327 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HRCP23327 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
HRCP23327 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
HRCP23327 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
HRCP23327 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
HRCP23327 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
HRCP23327 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
HRCP23327 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
HRCP23327 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
HRCP23327 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
HRCP23327 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms