Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PRKACBP22694 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKACBP22694 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKACBP22694 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKACBP22694 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKACBP22694 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKACBP22694 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKACBP22694 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKACBP22694 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKACBP22694 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms