Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI3P19429 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNI3P19429 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms